Objectifs :
1- Formaliser les processus biologiques par l’intermédiaire de différentes approches de modélisation mécaniste, statistique et théorique.
2- Acquérir plus généralement des compétences dans le domaine de la modélisation.
Plan des enseignements :
5 TD de 2H de remise à niveau ,4 cours de 3 H chacun, 2 séances de TD d’initiation à SCILAB, 3 séances (ou plus) d’enseignements intégrés en salle info de 3 H chacune, un projet personnel (équivalent à 10H pour les étudiants) : 47 H
5 TD de remise à niveau avec exemple écologique :
- Lois de distribution, bases de probabilités.
- Statistiques descriptives et tests d’hypothèses.
- Rappels de calcul de dérivés et d’intégrales.
- Résolutions d’équations différentielles.
- Calcul matriciel.
4 cours :
- Introduction à la modélisation
- Différents types de modèles I : statistiques (modèle linéaire et ANOVA) et probabilistes.
- Différents types de modèles II : modèles analytiques et simulations
- Validation des modèles, étude de sensibilité, introduction aux problèmes de spatialisation.
Les exemples pris au cours de ces 4 cours couvriront les trois types d’applications : écosystème (flux de masse et d’énergie), dynamique des populations structurées et non-structurées et génétique des populations.
5 ou 6 séances de TD et d’enseignement intégré avec initiation et programmation d’un modèle sur ordinateur avec SCILAB : exemples de simulation de la photosynthèse d’un couvert végétal, modélisation des systèmes proies-prédateurs et simulation du maintien du polymorphisme génétique.
Enseignants :
Kamel Soudani : prof UPS
Nicolas Delpierre : MdC UPS
Marc Girondot : prof UPS
Paul Leadley : prof UPS
Franck Courchamp : DR CNRS
Prérequis : connaissances de base en mathématiques et statistiques
Nombre maximum d’inscrits : 100
Nb d’heures : 60 h
Contrôle des connaissances :
Contrôle de projet personnel et oral, examen écrit.
- Première session : examen écrit/ soutenance orale/ rapport écrit (1/3 ; 1/3 ; 1/3)
- Deuxième session : examen écrit